發(fā)布日期:2018-04-04
由Van Andel研究院(VARI)和Cedars-Sinai的科學家領導的一個研究小組已經開發(fā)出一種簡單直觀的計算方法來測量細胞年齡,這一成果或可以會將帶來更好、更簡單的癌癥和其他疾病的篩查和監(jiān)測方法。
來源:CC0 Public Domain
4月2日發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上的這項研究結果揭示了一種漸進的、可測量的特定化學標記的缺失,這些化學標記調節(jié)基因活動,并在發(fā)育的最早階段就可以被檢測到。這些持續(xù)一生的變化可以反映細胞年齡,,是與細胞有關,而不是實際年齡,同時還預示著癌細胞的變化。
doi:10.1038/s41588-018-0073-4
這項工作是Cedars-Sinai的 Benjamin Berman博士和VARI的Peter W. Laird博士以及Hui Shen博士長期合作的結果。早在2011年, 它是基于Berman 和 Laird就首次明確在2011年的發(fā)現,當時他們首次確定這些DNA標記 (稱為甲基團)的缺失發(fā)生在癌癥基因組的特定區(qū)域。然而,當時使用的技術無法檢測到正常細胞中發(fā)生的這一過程。
Laird說:“當細胞開始分裂的時候,我們的細胞時鐘就已啟動進入了倒計時。新的方法使我們能夠追蹤過去細胞分裂的歷史,并測量與年齡相關的基因編碼變化,從而觀察它如何導致正常的衰老和功能障礙。”
人體中有接近40萬億個細胞,每一個細胞都可以追溯到一個單一的受精卵細胞,其中包含了個體DNA的原始版本。在人的一生中,這些細胞分裂,根據身體功能、環(huán)境污染和傷口愈合等因素,細胞分裂會以不同的速率替換舊的或受損的細胞。
盡管經過了精心設計的生物質量控制檢查,但每個細胞分裂都會破壞基因組的完整性,留下越來越多的變化。其中,最主要的是基因組上甲基團數量和位置的發(fā)生了巨大的變化,部分的過程從胚胎發(fā)育開始,并在整個生命周期中持續(xù)。
Berman說:“我們新方法的結果引人驚訝的是最新研究讓我們驚訝的是,它們將這一過程的開始推到子宮發(fā)育的最早階段。” “這完全令人驚訝這完全出乎意料,因為目前的假設是,這一過程在癌癥發(fā)展中相對較晚期。這一發(fā)現也表明,它在腫瘤形成過程中起著較早的作用。”
雖然DNA甲基化(稱為低甲基化)的缺失是許多癌癥的共同特征,但這一現象背后的機制至今仍未為人所知。“高轉換率的組織出現的癌癥更為嚴重,如皮膚和上皮細胞,因為有更多的機會來積累和迫使正常細胞改變?yōu)閻盒阅[瘤。”Shen說。“我們所看到的是一種正常的細胞衰老過程,一旦細胞癌變,它就會加速擴張。這種累積效應與失控貨運列車類似。”
這項研究涵蓋了39個不同的腫瘤,超過340個人類和200個小鼠數據(最深入的研究),如果沒有大規(guī)模測序項目(包括癌癥基因組圖譜)的大量公開數據,這是不可能實現的。DNA甲基化損失通常發(fā)生在癌癥基因組中,主要發(fā)生在被稱為部分甲基化的區(qū)域(PMDs)的層內相關的晚期復制區(qū)域內。
“這個研究項目是一個很好的例子,它將我們自己的數據與外部可用數據集相結合以發(fā)現新事物。”Zhou說,“如果這個項目是在三年前完成,那么故事的發(fā)展就會略有不同?,F在,由于獲得更廣泛的數據,我們才可以取得這項研究成果。”
參考資料
Scientists discover new method for measuring cellular age
來源:生物探索